Akonni TruTip and Qiagen Methods for Extraction of Fetal Circulating DNA – Evaluation by Real-Time and Digital PCR

入選理由:ddPCR作為一種高靈敏度檢測手段的出現,必將對上游的核酸純化產業帶來壓力。該文是ddPCR技術大規模應用后,第一篇致力于針對具體的應用改善核酸純化方法的應用文章。

發表期刊:PLOS ONE. August 2013 | Volume 8 | Issue 8 | e73068
作者:Rebecca C. Holmberg, Alissa Gindlesperger, Tinsley Stokes, David Lopez, Lynn Hyman, Michelle Freed, Phil Belgrader, Jeanne Harvey, Zheng Li;

文章摘要:
很多利用定量PCR方法進行低拷貝核酸檢測的研究人員很關心的問題之一就是檢測的靈敏度,也就是說能夠在多少拷貝的水平實現DNA或RNA分子穩定的檢出。其實靈敏度主要取決于2個主要的方面:樣品中核酸提取的效率和具體檢測體系的靈敏度,兩者一起決定了具體目標序列的檢測靈敏度。

隨著超靈敏度的微滴式數字PCR技術的出現,使得核酸純化成為低拷貝模板檢測過程中的瓶頸與限制性實驗步驟,對從樣品中進行高效的核酸分子提取提出了更高的要求。由Akonni Biosystems和Novartis的科學家共同完成的這篇文章以無創產前診斷或篩查(NIPD或NIPT)的應用為例,比較了Akonni Biosystems的TruTip和QIAGEN的Circulating Nucleic Acids試劑盒對于cffDNA提取的效果。對得到的核酸提取物分別采用定量PCR和ddPCR進行了分析,得到的結果顯示Akonni Biosystems對于片段化的胎兒游離DNA提取的得率比QIAGEN的試劑盒提高了約87%,且定量PCR的結果與ddPCR結果相關性良好。

對于核酸序列高效的提取,該文獻中雖然以NIPD或NIPT的應用為例,但對于其他的應用也具有重要的意義,例如從血漿或血清樣品中對腫瘤相關突變的早期檢測等。

發表評論

您的電郵不會被公布 必填字段標記為*

您可以使用這些abbr title="HyperText Markup Language">HTML 標簽和屬性: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <strike> <strong>

清除表單提交